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生物大分子与小分子识别和相互作用理论与计算研究工作取得新进展
www.sklmr.dicp.ac.cn    发布时间:2015-11-04    栏目类别:新闻动态

       细胞的组成包括具体功能行驶者生物大分子,包括蛋白质和核酸,以及它们所处的环境和功能调节剂小分子,包括有机分子,磷脂,水和金属离子等。而蛋白质与小分子,蛋白质本身及其复合物之间的结构、识别以及相互作用就是细胞发挥功能的两大生物物理化学基元过程,我所生物分子模拟研究组(1106)自2009年成立以来一直围绕着生物物理化学中两大基元过程开展理论方法发展和应用研究工作。

      药物分子与蛋白质靶标之间的识别及相互作用就是上述基元过程之一。随着人们对疾病的发生转移等分子机制研究和认识的不断深入,新药的研发成本和周期也越来越超出人们的预期。而已有的上市药物由于前期研究的不可预见性以及人体和疾病本身的复杂性,使得它们成为治疗一些疾病的首选药物。如何针对一种疾病和现有药物,在已经上市的药物中发现新的用途就成为当前研究的一个热点和难点。

       分子模拟与设计课题组基于多年在国际生物制药公司从事药物研发的经验,以及从事分子模拟理论计算方法发展方面的积累,与大连理工大学杨永亮教授合作,提出了全新的计算策略。利用药物分子本身三维构象以及物理化学特性的相似性,结合药物结合口袋本身的相似性,以及分子动力学模拟等计算手段,可以定位与预定药物功能相似的上市药物分子。针对老年痴呆症(Alzhmeir Disease/AD)已有的药物多奈哌齐,利用新发展的计算策略,发现了治疗肾癌的药物帕唑帕尼可以具有与之相类似的功能。经过实验合作者在蛋白质水平,AD老鼠模型水平上的实验证明,帕唑帕尼是具有治疗老年痴呆症的全新功效,而且用量只有原有治疗肾癌时使用药物的1/5,大大降低了毒性。拓展了已有药物的适用范围,为其他已有药物新功能的定位提供了新的研究策略。文章发表在Chemical Science 2015 "Computational discovery and experimental verification of tyrosine kinase inhibitor pazopanib for the reversal of memory and cognitive deficits in rat model neurodegeneration" http://pubs.rsc.org/en/Content/ArticleLanding/2015/SC/c4sc03416c 


      文章发表后,受到媒体关注,科技日报8月3号在头版对这一发现做了报道,随后包括中国日报中文网,中科院网站等多家新闻媒体进行了转载。

      最近,Chemical Science网站上公布的第三季度(7月-9月)下载最多的25篇文章列表中,上述文章名列第9,其中多余一半的关注是来自德国,同时,也是当期排名中最靠前的来自中国的文章!http://blogs.rsc.org/sc/2015/10/29/top-25-chemical-science-articles-july-september-2015/ (文/李国辉)。



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